Prosiding Penyidikan Penyakit Hewan

Permanent URI for this collection

https://repository.pertanian.go.id/handle/123456789/8753

Browse

Browsing Prosiding Penyidikan Penyakit Hewan by Author "A.S, Wahyuningtyas"

Now showing 1 - 1 of 1
  • No Thumbnail Available
    Item
    Dinamika Virus Avian Influenza Subtipe H5N1 di Wilayah Balai Veteriner Tahun 2004-2017
    (Direktorat Kesehatan Hewan, 2018) E. A., Srihanto; L, Angeliya; A.S, Wahyuningtyas
    Penyakit Avian Influenza sejak masuk ke wilayah Lampung tahun 2003 sampai sekarang belum bisa diatasi dengan baik. Kematian unggas sampai saat ini masih sering dilaporkan dan ditemukan. Unggas yang terinfeksi dilaporkan tidak hanya ayam tetapi jenis unggas lainnya seperti puyuh, itik, entog, kalkun, walet dan burung liar. Perkembangan virus Avian Influenza sejak ditemukan pada tahun 2003 telah mengalami evolusi dan perubahan. Kajian ini bertujuan untuk melihat dinamika dan evolusi virus Avian Influenza di wilayah kerja Balai Veteriner tahun 2004-2016. Materi yang digunakan berupa data sekuens virus Avian Influenza dari genebank dan koleksi Balai Veteriner Lampung tahun 2004-2017. Asal isolat isolat diperoleh dari berbagai macam spesies meliputi ayam, puyuh, kalkun, itik, entog, walet dan burung liar. Metoda analisis dilakukan dengan melihat jarak genetik, homologi dan hubungan kekerabatan virus Avian Influenza. Analisis dilakukan menggunakan perangkat lunak MEGA 6.06 yang meliputi prediksi asam amino, homologi, jarak genetik dan pohon kekerabatan. Hasil analisis menunjukkan bahwa sejak tahun 2004-2017 sebaran virus Avian Influenza di wilayah kerja Balai Veteriner ditemukan adanya 2 clade yaitu clade 2.1 dan 2.3.2.1c. Jarak genetik antara clade 2.1 dengan clade 2.1.3 sekitar 3% dengan homologi berkisar 97%. Jarak genetik antara clade 2.1 dengan clade 2.3.2.1 sekitar 8 % dengan homologi sekitar 91 %. Jarak genetik antara clade 2.1.3 dengan clade 2.3.2.1 sekitar 4,5% dengan homologi sekitar 95,5%. Sebaran unggas yang terinfeksi mencakup multi spesies unggas meliputi ayam, puyuh, kalkun, itik, entog, walet dan burung liar.