STUDI PENDAHULUAN VARIASI GENETIK JARAK PAGAR (Jatropha curcas L.) LOKAL BERDASARKAN RANDOM AMPLIFIED POLYMORPHIC DNA
Loading...
Date
2008
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Bayumedia Publishing
Abstract
Informasi mengenai variasi genetik plasma nutfah sangat diperlukan untuk mendukung program pemuliaan. Pe-nanda random amplified polymorphic DNA telah dipergunakan secara luas dalam studi variasi genetik tanaman. Pene-litian ini bertujuan untuk mendapatkan informasi variasi genetik tiga aksesi jarak pagar lokal (Karangtengah, Malang; Nusa Tenggara Barat; dan Lamongan) dengan menggunakan penanda molekuler random amplified polymorphic DNA. Penelitian dilaksanakan di Pusat Pengembangan Bioteknologi-Universitas Muhammadiyah Malang dengan mengguna-kan plasma nutfah jarak pagar koleksi Balai Penelitian Tanaman Tembakau dan Serat, Karangploso–Malang. Hasil pe-nelitian menunjukkan bahwa dari 3 aksesi plasma nutfah jarak pagar yang diamplifikasi dengan menggunakan 14 pri-mer RAPD (OPA 2, OPA 9, OPA 10, OPA 13, OPA 15, OPA 18, OPA 19, OPA 20, OPF 6, OPF 8, OPF 10, OPF 13, OPF 15, dan OPF 18) telah diperoleh total sejumlah 75 pita DNA pada jarak pagar aksesi Karangtengah; 91 pita pada aksesi Lamongan; dan 60 pita pada aksesi NTB. Pita-pita DNA yang dihasilkan dalam reaksi PCR-RAPD tersebut ber-variasi, dengan ukuran antara 200 bp sampai 2642 bp. Pemakaian primer OPA 18 dan OPA 20 memberikan pola pita DNA yang serupa pada ketiga aksesi tanaman jarak pagar yang diuji. Primer OPA 13, OPA 15, OPA 19, dan OPF 8 ti-dak memberikan perbedaan pada pola pita DNA yang dihasilkan dari jarak pagar aksesi Karangtengah dan aksesi La-mongan, namun pada aksesi NTB diperoleh perbedaan pola pita DNA yang dihasilkan dibandingkan kedua aksesi lain-nya.
Description
Keywords
Jatropha curcas L.,, RAPD,, penanda molekuler,, jarak pagar,