Identifikasi Virus Classical Swine Fever pada Babi di Provinsi Sumatera Utara Tahun 2016
No Thumbnail Available
Date
2018
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Direktorat Kesehatan Hewan
Abstract
Classical swine fever (CSF) virus adalah virus yang menginfeksi ternak babi dan merugikan secara ekonomi karena tingkat morbiditas dan mortalitas yang tinggi. Propinsi Sumatera Utara merupakan salah satu sentral peternakani babi terbesar di Indonesia untuk itu perlu dilakukan monitoring penyakit pada ternak babi dan salah satunya adalah CSF. Studi ini bertujuan melakukan identifikasi dan distribusi virus CSF di Sumatera Utara. Sebanyak 816 darah (EDTA) dari 285 pemilik (farm) berhasil dikoleksi dari 20 Kabupaten/Kota di Sumatera Utara pada tahun 2016. Hasil pemeriksaan sampel secara qRT-PCR tahun 2016 ditemukan 61 sampel positif virus CSF yang tersebar di 9 kabupaten. Sebanyak 8 sampel berhasil di sekuen pada gen E2 secara parsial. Filogram yang dibentuk menggunakan software MEGA 7.0 dan Beast 1.8 kedelapan sekuen tersebar dalam 3 genotipe virus CSF. Hal ini menandakan virus CSF yang ada di Sumatera Utara kemungkinan telah mengalami divergenitas genetik dan mempunyai turunan virus yang berbeda-beda. Kajian terbatas perlu dilakukan dalam hal penentuan jenis vaksin yang beredar di Sumatera Utara berkaitan ditemukannya berbagai genotipe virus CSF di Sumatera Utara.
Description
Keywords
RT-PCR, Sekuen E2, CSF, Sumatera Utara