Optimasi Program Amplifikasi RT-PCR Penyakit Jembrana pada Gen Gag Secara Utuh untuk Sekuensing dan Analisis Genetik
| dc.contributor.author | L, Angeliya | |
| dc.contributor.author | E. A., Srihanto | |
| dc.date.accessioned | 2020-03-26T04:58:20Z | |
| dc.date.available | 2020-03-26T04:58:20Z | |
| dc.date.issued | 2018 | |
| dc.description.abstract | Penyakit Jembrana disebabkan oleh lentivirus dari fam.ilia retroviridae. Wabah penyakit Jembrana saat ini terjadi di wilayah kerja Balai Veteriner Lampung. Sebanyak 21 kabupaten/kota sudah terkonfirmasi positip penyakit Jembrana. Virus penyakit Jembrana menyandi 3 gen utama yaitu gag, pol dan env. Pengujian telah dilakukan secara molekuler menggunakan tehnik RT-PCR pada gen gag secara parsial. Data dan penelitian awal tentang gen gag secara utuh masih sangat kurang. Penelitian ini bertujuan memperoleh suhu annealing yang optimal pada gen gag secara utuh yang nantinya akan digunakan untuk sekuensing dan analisis genetik. Primer yang digunakan pada gen gag sepanjang 1311 bp dibagi dalam 3 region. Desain primer dilakukan dengan perangkat lunak Primer3 dan terbagi menjadi 3 region dengan 1 pasang primer pada masing-masing region. Panjang amplikon yang didapatkan yaitu 468 bp, 719 bp dan 638 bp. Annealing masing-masing region pada suhu 500C, 530C, 550C, 580C, 600C, 630C dan 650C. Optimasi program RT-PCR penyakit Jembrana gen gag berjalan dengan baik. Suhu annealing optimal untuk region 1, 2 dan 3 adalah 530C, 550C dan 600C. Primer tersebut dapat digunakan untuk melakukan sekuensing dan analisis genetik virus Jembrana. | en_US |
| dc.identifier.uri | https://repository.pertanian.go.id/handle/123456789/8834 | |
| dc.language.iso | id | en_US |
| dc.publisher | Direktorat Kesehatan Hewan | en_US |
| dc.subject | Penyakit jembrana | en_US |
| dc.subject | Optimasi | en_US |
| dc.subject | Annealing | en_US |
| dc.subject | Sekuensing | en_US |
| dc.title | Optimasi Program Amplifikasi RT-PCR Penyakit Jembrana pada Gen Gag Secara Utuh untuk Sekuensing dan Analisis Genetik | en_US |
| dc.type | Article | en_US |