Sequence Analysis of 2b Gene of Australian CMV Isolates
No Thumbnail Available
Date
2009-12
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
BB Biogen
Abstract
Analisis Sekuen Gen 2b pada Isolat CMV asal Australia. Virus gen 2b dari Cucumber Mosaic Virus (CMV) dilaporkan sebagai suppressor gene silencing, determinan pergerakan sistemik, dan determinan hipervirylen spesifik. Penelitian dilakukan untuk menganalisis tujuh isolat CMV asal Australia serta untuk sekuensing dan menganalisis gen 2b dari isolat tersebut. Selanjutnya dilakukan pengelompokan (subgrouping) ketujuh isolat tersebut berdasarkan sekuen gen 2b, sekuen protein, dan ukuran dari gen 2b ORF. Hasil penelitian menunjukkan bahwa ketujuh isolat CMV tersebut dapat dikelompokkan menjadi tiga subgrup, yaitu subgrup IA (CMV 207, CMV 237, CMV 242, dan Twa CMV), subgrup IB (CMV 243), dan subgrup II (CMV 241 dan CMV 245). Selanjutnya, gen 2b dalam subgrup Ia and II ukuran dan sekuannya bersifat conserved dan mengandung suatu nuclear localisation signal (NLS).
Description
Keywords
Cucumber Mosaic Virus (CMV), isolate subgrouping, RT-PCR.