Identifikasi molekuler beberapa varietas durian (Durio spp) menggunakan Random Amplified Polymorphic DNA (Molecular Identification of some durian varieties using Random Amplified Polymorphic DNA)
Loading...
Date
2016-05-31
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
BB Pengkajian dan Pengembangan Teknologi Pertanian
Abstract
Indonesia terdapat banyak jenis atau varietas durian yang telah dilepas atau durian lokal yang mempunyai keunggulan berbeda-beda, dimana keragaman varietas tersebut belum tentu mencerminkan keragaman genetiknya. Penelitian bertujuan mengidentifikasi fragmen DNA spesifik yang membedakan idividu atau kelompok individu tanaman durian yang digunakan dan mengetahui kekerabatannya. Penelitian dilaksanakan mulai bulan JulihinggaDesember 2014 di laboratorium molekuler Balai Penelitian Tanaman buah Tropika (Balitbu Tropika). Enam belas varietas durian digunakan sebagai sampel pada analisis Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) dengan menggunakan 14 primer. Hasil analisis menunjukkan bahwa tingkat polimorfisme 14 primer yang diuji berkisar antara 83% - 100%
dengan
rata-rata
97%.Belum diperoleh marka molekuler yang dapat digunakan untuk
penciri khusus varietas, tetapi metode ini mampu membedakan varietas
Montong Daun
Pendek
dengan
Montong Daun panjang secara genetik. Analisis
kluster UPGMA
(Unweighted Pair Group Method with Arithmetic), menunjukkan bahwa 16 aksesi yang
diuji terpisah menjadi empat kelompok dengan nilai kemiripan genetic berkisar 35% - 81%. Aksesi yang mempunyai kesamaan genetik terbesar yaitu antara Kanjau dengan Montong Daun Panjang (81%), dan terkecil yaitu antara durian Merah Banyuwangi dengan Sunan Gendol (35%). Hasil penelitian ini dapat dimanfaatkan sebagai alat bantu dalam pemilihan tetua durian yang tepat dalam program perakitan varietas unggul baru.
Description
Keywords
Durio SPP, Identifikasi Molekuler, RAPD