Teknik Isolasi DNA dan Analisis PCR Gen pinll pada Genom Ubi Jalar
No Thumbnail Available
Date
2002-11
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Balai Penelitian Bioteknologi dan Sumberdaya Genetik Pertanian
Abstract
Konfirmasi awal gen-gen target pada tanaman putatif transgenik akan sangat
berguna, karena tanaman yang tidak mengandung gen yang diintroduksi dapat
langsung diketahui, sehingga hanya tanaman yang mempunyai gen yang
diinginkan yang digunakan untuk penelitian selanjutnya. Identifikasi terjadinya
integrasi gen pada tanaman transgenik dapat dilakukan dengan teknik
Polymerase Chain Reaction (PCR). Untuk dapat mendeteksi ada tidaknya gen
target yang tersisip dalam genom tanaman ubi jalar transgenik dengan teknik
PCR, diperlukan ONA terekstrak dengan kualitas dan kuantitas yang baik. Pada
tahun 2001 dilakukan penelitian analisis molekuler untuk mengkonfirmasi ter
jadinya integrasi gen p/nll ke dalam genom ubi jalar. DNA diisolasi dari daun
tanaman putatif transgenik ubi jalar menggunakan 2 metode ekstraksi, yaitu
metode CTAB dari Porebski ef al. dan Varadarajan dan Prakash yang dimodifikasi
dan metode CTAB dari Tanaka dan Nakatani. Modifikasi dilakukan untuk
mengurangi kadar polifenol dan polisakarida. Dari kedua metode ekstraksi DNA
tersebut, metode CTAB dari Tanaka dan Nakatani mempunyai kualitas DNA
yang lebih baik dibandingkan dengan metode CTAB yang dimodifikasi dari
Porebski at al. dan Varadarajan dan Prakash. Pada analisis PCR, telah diamplifikasi
sebanyak 13 tanaman ubi jalar putatif transgenik dan dari 13 tanaman ter
sebut, belum ada yang positif mengandung gen p/nll.
Description
Keywords
Ubi jalar, isolasi DNA, gen p/nll, analisis PCR